One of unusual and most intriguing feature of heavily mutated オミクロン variant is that it acquired all the mutations in a single burst in a very short span of time. The degree of change is so much so that some people think it could well be a new strain of human コロナウイルス (SARS-CoV-3 ?). How such a high level of mutation may have occurred in such a short span? Some argue that オミクロン may have evolved from an immune suppressed patient with some chronic infection like HIV/AIDS. Or, could it have evolved in the current wave in ヨーロッパ which has witnessed very high transmission rates? Or, could it be associated with some Gain-of function (GoF) research or anything else? Who benefits? It is not possible to draw any conclusion at this stage. Nevertheless, this article attempts to throw light on various dimensions associated with the phenomenon.
最近報告された19日の南アフリカからの新しいCOVID-25バリアントth 2021年XNUMX月は、世界のいくつかの国、つまり英国、カナダ、日本、オーストラリア、オーストリア、香港、イスラエル、スペイン、ベルギー、デンマーク、ポルトガルに広がりました。 これは、WHOによって新たな懸念物質（VOC）として指定され、名前が付けられています オミクロン。 オミクロンは、元のウイルスと比較して、スパイクタンパク質に30のアミノ酸変化、XNUMXつの小さな欠失、XNUMXつの小さな挿入が特徴です。1。 ただし、突然変異率に基づく2 RNAウイルスの場合、一晩で30以上の変異を発生させることはできません。 ウイルスが自然に受ける変異率に基づいて、SARS-CoV-3の5kbゲノムに6つの変異を生成するには、少なくとも30〜2か月かかります。2 ホストからホストへの送信時。 この計算を行うと、オミクロンのようなものが出現し、15の突然変異を持っているのに25〜30か月かかるはずです。 しかし、世界はこの段階的な突然変異が上記の期間にわたって上昇するのを見ていません。 この変異体は、免疫不全患者、おそらく未治療のHIV / AIDS患者の慢性感染から進化したと主張されています。 変化の程度に基づいて、それはウイルスの新しい株として分類されるべきです（SARS-CoV-3はそうかもしれません）。 それにもかかわらず、存在する突然変異の数は、他の変異体よりも伝達率が高いことを示している可能性があります。 ただし、これを確認するには、さらに調査が必要です。
次の数週間は、新しい亜種の伝染性とそれが引き起こす病気の重症度を決定するために重要です。 これまで、すべての症例は軽度で無症候性であり、良いニュースは死亡率がなかったことです。 また、新しい亜種が現在のワクチンによって提供される免疫防御をどの程度回避できるかを評価する必要があります。 これにより、新しいバリアントに合わせてワクチンを作成する前に、現在のワクチンをどれだけ継続できるかを決定できます。 ファイザーとモデルナは、ワクチンの調整に向けてすでに対策を講じています。 ただし、この亜種の起源については、まだ疑問が残ります。 オミクロン変異体は、ヨーロッパでの症例発生率がはるかに高い現在の波の中で進化した可能性がありますが、最近南アフリカ当局によって報告されました（ゲノム配列決定に基づく）。 ただし、現在の波は過去4〜5か月間存在しており、突然変異率によれば、5〜6を超えない突然変異が発生するはずであるため、これは当てはまらない可能性があります。
Or was オミクロン, a product of Gain of Function (GoF) research leading to development of pandemic potential pathogens (PPPs)3,4。 機能獲得研究とは、病原体（この場合はSARS-CoV-2）が、通常の存在の一部ではなかった機能を実行する能力を獲得する実験を指します。 この場合、それは伝達性の増加と毒性の増加につながる可能性があります。 これは、新規で自然界には存在していなかった生物の発生につながる可能性があります。 GoF研究の目的は、病原性多様体を理解し、そのような変種が自然界で発生した場合に、治療薬またはワクチンを準備することです。 PPPによって得られた突然変異の数は、菌株の感染性を高めるだけでなく、回復期の個人の元のウイルスに対して作られた中和抗体を逃れるのにも役立ちます。 さらに、標的RNA組換えに基づく最新の遺伝子工学技術を使用して株操作が可能です5。 これはまた、より多くの突然変異を伴う新規の病原性変異体/株につながる可能性があり、伝染性が高く毒性の高いウイルスにつながる可能性があります。 研究によると、SARS-CoV-20に感染またはワクチン接種された個人の血漿で生成された抗体の大部分を回避するには、変化や欠失を含むスパイクタンパク質で発生する2の変異で十分であることが示されています。6。 別の研究によると、強い免疫圧の下で、SARS-CoV-2は、N末端ドメインに3つの欠失、スパイクタンパク質に483つの変異（EXNUMXK）のXNUMXつの変更を加えるだけで、抗体を逃れる能力を得ることができます。7.
PPPの生成につながるこの種の研究を許可する必要がありますか？ 実際、米国疾病予防管理センターで病原体の取り扱いを誤った一連の事故が発生した後、2014年にNIHによって機能研究の獲得が禁止されました。これは、この種の研究に関連するリスクが、それが提供するかもしれない利益。 そのようなPPPの出現と普及から誰が恩恵を受けますか？ これらは本当の答えを必要とする難しい質問です。
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参照：
- 欧州疾病予防管理センター。 SARSCoV-2B.1.1の出現と拡散の意味。 EU / EEA向けの529種類の懸念物質（オミクロン）。 26年2021月2021日。ECDC：ストックホルム。 XNUMX年。オンラインで入手可能 https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529
- Simmonds P.、2020年。SARS-CoV-2およびその他のコロナウイルスのゲノムにおける横行するC→U超変異：それらの短期および長期の進化の軌跡の原因と結果。 24年2020月XNUMX日。DOI： https://doi.org/10.1128/mSphere.00408-20
- NIH（アメリカ国立衛生研究所。 強化された潜在的なパンデミック病原体を含む研究。 （20年2021月XNUMX日にレビューされたページ。 https://www.nih.gov/news-events/research-involving-potential-pandemic-pathogens
- 「機能獲得」研究の変化する砂。 Nature 598、554-557（2021）。 土井： https://doi.org/10.1038/d41586-021-02903-x
- Bert Jan Haijema、Haukeliene Volders、Peter JMRottier。 種の屈性の切り替え：猫コロナウイルスゲノムを操作する効果的な方法。 ウイルス学ジャーナル。 巻77、No.8。DOI： https://doi.org/10.1128/JVI.77.8.4528-4538.20033
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- アンドレアノE.、 ら 2021. SARS-CoV-2は、高度に中和するCOVID-19回復期血漿から脱出します。 PNAS 7年2021月118日36（2103154118）eXNUMX; https://doi.org/10.1073/pnas.2103154118
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