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COVID-19の診断テスト:現在の方法、実践および将来の評価

国際的な専門家団体の助言に従って現在実施されているCOVID-19の診断のための臨床検査がレビューされ、評価されます。

COVID-19 病気、中国の武漢で発生し、これまでに208カ国以上に影響を与えてきました。 全世界の科学界は、過去数か月の間に、発展するという重大な課題に直面してきました。 診断検査 for コロナ パンデミックを効果的に管理および制御するために、患者および疑わしい個人をスクリーニングするための疾患検出。

COVID-19の検出に使用されている現在の方法と実践を評価する前に、まずCOVID-19の原因と、この病気の患者をスクリーニングするための診断テストをどのように開発するかを理解しましょう。 COVID-19病は、プラス鎖RNAによって引き起こされます ウイルス 人獣共通感染症です。つまり、動物から人間への種の壁を越え、一般的な風邪からMERSやSARSなどのより重篤な病気に至るまでの病気を引き起こす可能性があります。 COVID-19を引き起こすウイルスは、SARSの発生を引き起こしたウイルス(SARS-CoV)と非常によく似ているため、国際ウイルス分類委員会(ICTV)によってSARS-CoV-2と名付けられました。 COVID-19感染症の診断テストは、さまざまな方法で開発できます。

世界中で最も人気があり、現在採用されている方法は、SARS-CoV-2ウイルス自体を検出できる診断テストを開発することです。 この test これは、RT-リアルタイムPCR(逆転写酵素-リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応)による患者サンプル中のウイルスゲノムの検出に基づいています。 これには、逆転写酵素と呼ばれる酵素を使用してウイルスRNAをDNAに変換し、Taqポリメラーゼを使用して蛍光シグナルを検出し、ウイルスDNAの特定の領域に結合する特定のプライマーセットと蛍光プローブを使用してDNAを増幅する必要があります。 これらの検査はNAAT(核酸増幅検査)と呼ばれます。 この技術は、COVID-19疾患の症状を示さない無症候性の患者(特に14〜28日間の潜伏期間)や後の部分でさえ、患者サンプル中の核酸の存在を非常に早期に検出するのに非常に役立ちます。病気が本格的な場合も同様です。

CDC(Centre for Disease Control)、米国アトランタ、およびWHOガイドライン( 2、1)。 世界中の保健当局は、SARS-CoV-2の検出のための緊急使用のためにこれらの検査を承認しています。 これまでに標的とされたウイルス遺伝子には、N、E、S、およびRdRP遺伝子と、適切なポジティブおよびネガティブコントロールが含まれます。 このような検査のために収集される患者サンプルは、上気道(鼻咽頭および口腔咽頭スワブ)および/または下気道(喀痰および/または気管内吸引物または気管支肺胞洗浄)からのものです。 ただし、糞便や血液などの他のサンプルからウイルスを検出することも可能です。 サンプルは、COVID-2の疑わしい症例定義を満たす患者から、必要なすべての予防措置を講じ、バイオセーフティの実践(WHO [1]によって定められたガイドラインに従って)を遵守し、適切な方法で迅速に収集する必要があります。診断センターに輸送してから、サンプルの完全性を確保する方法で迅速に処理(BSL-19または同等の施設のバイオセーフティキャビネットでRNAを抽出)する必要がある場合に適しています。 これはすべて、より良い臨床管理とアウトブレイク制御のために優先的に実行する必要があります。

世界中の主要な診断会社によって開発されたさまざまな利用可能なNAATベースのテストの検出時間は、45分から3.5時間までさまざまです。 これらの検査をポイントオブケア検査に変換し、結果の精度を損なうことなく可能な限り短時間で目的の結果を達成し、XNUMX日に実行できる検査の数を増やすために、さまざまな改善が行われています。

その他の診断テストオプションは次のとおりです。 迅速診断検査(RDT) SARS-CoV-2ウイルス粒子が宿主細胞で複製し、感染に応答して疾患または宿主抗体を引き起こすときに、SARS-CoV-19ウイルス粒子の表面に発現するウイルス抗原/タンパク質を検出する。 この検査は、COVID-3に感染したと思われる人々の血液中の抗体の存在を検出します(XNUMX)。

ウイルス抗原を検出するためのRDTの精度と再現性は、病気の発症からの時間、サンプル中のウイルスの濃度、サンプルの品質と処理、およびテストキットに含まれる試薬の配合を含むいくつかの要因に依存します。 これらの変数により、これらのテストの感度は34%から80%まで変化する可能性があります。 このオプションの主な欠点は、ウイルスタンパク質を検出するために、ウイルスが複製および感染段階にある必要があることです。

同様に、宿主抗体を検出する検査は、年齢、栄養状態、病気の重症度、免疫系を抑制する特定の薬物療法や感染症などの要因に依存する抗体反応の強さに基づいています。 このオプションの主な欠点は、SARS-CoV-2ウイルスに感染してから数日から数週間かけて抗体が産生され、テストを実行するためにそれだけ長く待たなければならないことです。 これは、宿主抗体反応に基づくCOVID-19感染の診断は、臨床的介入または病気の伝染の予防の機会の多くがすでに過ぎている回復段階でのみ可能になることが多いことを意味します。

現在、上記のRDTは研究環境でのみ承認されており、データが不足しているため臨床診断には承認されていません(3、4)。 COVID-19で利用できる疫学データが増えるにつれ、平均してかかるNAATベースの検査とは対照的に、10〜30分で結果が得られるため、臨床現場でのポイントオブケア検査としてより多くのRDTが開発され、承認される予定です。病気を検出するための数時間。

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参照:
1. WHO、2020年。COVID-19の臨床検査戦略の推奨事項。 暫定ガイダンス。 21年2020月XNUMX日。オンラインで入手可能 https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/331509/WHO-COVID-19-lab_testing-2020.1-eng.pdf 09年2020月XNUMX日にアクセス
2.CDC2020。研究所向けの情報。 研究所の暫定ガイダンスは、オンラインで入手できます。 https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-nCoV/lab/index.html 09年2020月XNUMX日にアクセス。
3. WHO、2020年。ポイントオブケア検査の使用に関するアドバイス。 サイエンティフィックブリーフ。 08年2020月XNUMX日。オンラインで入手可能 https://www.who.int/news-room/commentaries/detail/advice-on-the-use-of-point-of-care-immunodiagnostic-tests-for-covid-19 09年2020月XNUMX日にアクセス。
4. ECDC、2020年。EU/ EEAにおけるCOVID-19診断の迅速検査状況の概要。 01年2020月XNUMX日。欧州疾病予防管理センター。 オンラインで入手可能 https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/overview-rapid-test-situation-covid-19-diagnosis-eueea 09年2020月XNUMX日にアクセス

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ラジーブソニ
ラジーブソニhttps://www.RajeevSoni.org/
Rajeev Soni博士(ORCID ID:0000-0001-7126-5864)は博士号を取得しています。 英国ケンブリッジ大学でバイオテクノロジーの博士号を取得し、スクリップス研究所、ノバルティス、ノボザイムズ、ランバクシー、バイオコン、ビオメリューなどのさまざまな研究所や多国籍企業で、また米国海軍研究所の主任研究員として、世界中で25年の経験があります。薬物発見、分子診断、タンパク質発現、生物学的製造および事業開発において。

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