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SARS-CoV-2:B.1.1.529の亜種はどれほど深刻で、現在はオミクロンと呼ばれています

B.1.1.529バリアントは、24日に南アフリカからWHOに最初に報告されました。th 2021年1.1.529月。最初に確認されたB.9感染は、XNUMX日に収集された検体からのものでした。th November 20211。 別の情報源2 このバリアントが11日に収集されたサンプルで最初に検出されたことを示しますth 2021年14月ボツワナおよびXNUMX日th 南アフリカで2021年19月。 それ以来、南アフリカのほぼすべての州でCOVID-27の症例数が急増しています。 XNUMXのようにth 2021年XNUMX月、この亜種の新しい症例がベルギー、香港、イスラエル、英国でも報告されています。3、ドイツ、イタリア、チェコ共和国。これらはすべて旅行関連です。  

WHOの専門家グループが26日に会合できるように、関連情報を世界の科学コミュニティと伝達および共有することに時間を割かなかった南アフリカ当局に感謝します。th 2021年1.1.529月、このバリアントを懸念されるバリアント(VOC)として迅速に指定します。 問題の深刻さは、B.24がわずかXNUMX日前のXNUMX日に監視下のバリアント(VUM)に指定されたという事実から判断できます。th 2021日にVOCに指定される前の26年XNUMX月th 調査中のバリアント(VOI)として最初に指定されていない2021年XNUMX月。  

表:2年26月2021日現在のSARS-CoV-XNUMX懸念変異株(VOC) 

WHOラベル  系統   最初に検出された国(コミュニティ)  最初に検出された年と月  
アルファ  B.1.1.7、XNUMX、XNUMX、XNUMX  イギリス  September 2020  
ベータ  B.1.351、XNUMX、XNUMX、XNUMX  南アフリカ共和国  September 2020  
ガンマ  P.1  ブラジル  12月5日  
デルタ  B.1.617.2、XNUMX、XNUMX、XNUMX  India  12月5日 
オミクロン  B.1.1.529、XNUMX、XNUMX、XNUMX 複数の国、2021年XNUMX月 監視中のバリアント(VUM):24年2021月XNUMX日  懸念される変異株(VOC):26年2021月XNUMX日 
(出典:WHO4、SARS-CoV-2バリアントの追跡)  

B.1.1.529を懸念のバリアント(VOC)として指定することの緊急性は、このバリアントがこれまでのところSARS-CoV-2の最も多様なバリアントであることが判明したために保証されました。 中国の武漢で最初に検出されたSARS-CoV-2ウイルスと比較すると、これには30ものアミノ酸の変化、3つの小さな欠失、およびスパイクタンパク質への1つの小さな挿入があります。 これらの変化のうち、15個は受容体結合ドメイン(RBD)に位置しています。これは、ウイルスの一部であり、ウイルスがヒト細胞に侵入して感染を引き起こす可能性があります。 このバリアントには、他のゲノム領域にも多くの変更と削除があります2。 突然変異は非常に広範囲であるため、変異体ではなく、新しい株と呼ぶことができます。 非常に大量のスパイク変異は、この変異体を重大な懸念事項にする既知の抗体からの脱出の可能性が高まることを意味します5.  

新しい亜種への変更はコロナウイルスに共通です。 コロナウイルスは、ポリメラーゼのヌクレアーゼ活性の校正が不足しているため、ゲノム内で非常に高い割合で変異するのは常に自然なことです。 より多くの伝達、より多くの複製エラー、したがってより多くの突然変異がゲノムに蓄積し、新しい変異体につながります。 人間のコロナウイルスは、最近の歴史の中で新しい変異体を作成するために突然変異を構築してきました。 最初のエピソードが記録された1966年以来、エピデミックの原因となるいくつかの亜種がありました6。 しかし、なぜ1.1.529回のバーストでこのような大規模な突然変異が発生するのでしょうか。 おそらく、B.XNUMX変異体は、免疫不全の人、おそらく未治療のHIV / AIDS患者の慢性感染中に進化したためです。7.  

広範な突然変異の原因が何であれ、南アフリカでの急速な広がりが何らかの兆候である場合、この変異体の進化は、現在使用されている既存のワクチンの免疫、伝染性、病原性、および有効性に多大な影響を与える可能性があります。  

既存のワクチンがこの新しい亜種に対して有効であり続けるかどうか、またはワクチンのブレイクスルー感染の事例が増えるかどうかにかかわらず、結論を引き出すために現在利用できるデータはほとんどありません。 しかし、最近の研究では、スパイクタンパク質に20の変異がある合成変異体は、抗体からのほぼ完全な脱出を示しました7。 これは、突然変異がはるかに増加した新しいバリアントB.1.1.529が、抗体による中和の大幅な低下を示す可能性があることを示しています。 ただし、現在のデータは信頼できる推定値を引き出すのに十分ではありませんが、新しいバリアントは、南アフリカのデルタバリアントに取って代わった急速な速度でより伝染性が高いようです。 同様に、この段階では症状の重症度についてコメントすることはできません。  

過去数週間、ヨーロッパがすでに異常に多くのCOVID 19症例(伝染性の高いデルタ変異による)で動揺しているという事実と、その急速な速度を考慮して オミクロン (B.1.1.529)バリアントは最近南アフリカに広がり、デルタバリアントに取って代わりました。英国、ドイツ、イタリアを含むヨーロッパのいくつかの国は、南アフリカおよびボツワナ、マラウィ、モザンビーク、ザンビアなどの近隣諸国からの到着に旅行制限を課しています。アンゴラ。 最悪の事態を恐れて、イスラエルはすべての国からの訪問者の入国を禁止することです。  

世界は、パンデミックから人々を守るために、COVID-19ワクチンの開発と投与に多大な投資を行ってきました。 科学者や当局の頭の中で最も重要な問題は、ファイザー-バイオエヌテック、オックスフォード-アストラゼネカ、モダナ、ジョンソン&ジョンソンなどの主要なCOVID-19ワクチンがオミクロン(B.1.1.529)変異体に対しても有効であり続けるかどうかです。 。 これは、南アフリカでブレイクスルー感染が報告されているという事実によって促進されています。 香港のXNUMXつの症例もワクチン接種を受けていた9

「パンコロナウイルス」ワクチンの開発10 (多価ワクチンプラットフォーム11)時間の必要性のようです。 しかし、より迅速に、突然変異をカバーする追加免疫用量のmRNAおよびDNAワクチンを迅速に製造することが可能かもしれません。 さらに、最近承認された 抗ウイルス薬 (メルクのモルヌピラビルとファイザーのパクスロビッド)は、入院や死亡から人々を守るのに役立つはずです。   

 *** 

参照:  

  1. WHO 2021.ニュース–オミクロンの分類(B.1.1.529):SARS-CoV-2の懸念の変種。 26年2021月XNUMX日公開。オンラインで入手可能 https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern  
  1. 欧州疾病予防管理センター。 SARSCoV-2B.1.1の出現と拡散の意味。 EU / EEA向けの529種類の懸念物質(オミクロン)。 26年2021月2021日。ECDC:ストックホルム。 XNUMX年。オンラインで入手可能 https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529  
  1. 英国政府 2021. プレスリリース – 英国で初めてオミクロン亜種の症例が確認されました。 27 年 2021 月 XNUMX 日に公開。 https://www.gov.uk/government/news/first-uk-cases-of-omicron-variant-identified   
  1. WHO、2021年。SARS-CoV-2バリアントの追跡。 オンラインで入手可能 https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 
  1. GitHub、2021年。ThomasPeacock:B.1.1南アフリカに関連する子孫で、スパイク変異の数が多い#343。 オンラインで入手可能 https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/343 
  1. プラサドU.2021。 コロナウイルスの亜種:これまでにわかっていること。 科学的なヨーロッパ人。 12年2021月XNUMX日に投稿されました。オンラインで入手可能 http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/variants-of-coronavirus-what-we-know-so-far/ 
  1. GAVI 2021.ワクチンの仕事–新しいB.1.1.529コロナウイルスの亜種について私たちは何を知っていますか?心配する必要がありますか? で利用可能 https://www.gavi.org/vaccineswork/what-we-know-about-new-b11529-coronavirus-variant-so-far 
  1. Schmidt、F.、Weisblum、Y.、Rutkowska、M。etal。 SARS-CoV-2ポリクローナル中和抗体の逃避に対する高い遺伝的障壁。 自然(2021年)。 https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0 
  1. 大きく変異したコロナウイルスの亜種は、科学者を警戒させます。 自然 News。 27年2021月XNUMX日更新。DOIhttps://doi.org/10.1038/d41586-021-03552-w  
  1. Soni R. 2021.「パンコロナウイルス」ワクチン:RNAポリメラーゼがワクチン標的として出現します。 科学的なヨーロッパ人。 16年2021月XNUMX日公開。 http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/pan-coronavirus-vaccines-rna-polymerase-emerges-as-a-vaccine-target/  
  1. NIH2021。ニュースリリース– NIAIDは、「パンコロナウイルス」ワクチンに資金を提供するための新しい賞を発行します。 28年2021月XNUMX日に投稿されました。 https://www.nih.gov/news-events/news-releases/niaid-issues-new-awards-fund-pan-coronavirus-vaccines  

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ウメシュプラサド
ウメシュプラサド
科学ジャーナリスト | 『Scientific European』誌創設編集者

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